中庙始建于东吴赤乌二年，因位居庐州、巢州之间而得名。先时祭祀主巢湖波涛的人姥，后来也祭奉传为泰山玉女的碧霞元君，汉时造基，唐代完工，历史上或毁于兵燹，或废于失修。光绪十五年(1889年)，李鸿章倡募重修，共前中后3殿70余间。现今修葺后的中庙，基本恢复了李鸿章时代的原貌。
中庙又名"忠庙"、"圣妃庙"。距巢湖市48公里，坐落在巢湖北岸凤凰矾上。居巢县、合肥之中间，故名。矾为一红色砂砾岩半岛，突兀临湖，形如飞凤。相传，三国时期，黎民陷于洪水浩劫之中，巢州太姥预知天机，登上凤凰矾拯救溺水者，后人便建庙以把。现有殿阁为清末所建，三进，四合院，有房70余间，木质结构。此地三面临水，楼台高峙，气势巍峨，有"湖天第一胜境"之誉。游人可登高远眺。明御史储良村有诗："湖上高楼四面开，夕阳徙倚首重回。气吞吴楚千帆落，影动星河五夜来。"民国37年，后进大院遭受火灾，仅存庙舍24间。庙东侧有清末李鸿章为纪念淮军所建的昭忠相。
中庙建于鳌背洞上。庙中有一井，直通洞穴，从井口俯视，可见巢湖水面，中庙佛教文化昌盛，佛事活动源远流长，庙内常年晨钟墓鼓，偈音缭绕，清香弥温。湖凌空而建，与姥山岛隔水相望，称“湖天第一胜景”。巢城---姥山岛，合肥---中庙水上旅游线，乘高速游轮，只需45分钟。矗立于湖心的姥山岛，面积0.86平方公里，古有望儿塔、圣妃庙，今建娱乐城、度假村，来此游览犹如进入“虚幻梦境”、“世外桃源”。